间充质干细胞治疗引起的发烧与免疫反应、炎症反应无关。
间充质干细胞输入治疗后，发烧是最常见的不良反应，文献中的最高发生率大概为39°。一般无需特别处理，病人会自然恢复。有研究推测发烧的原因可能与输入异体间充质干细胞引起的急性炎症反应有关。但是，间充质干细胞具有低免疫原性，而且有“免疫豁免”的特性，因此难于引起免疫排斥反应。更直接的证据就是MSC能有效地治疗各种免疫性疾病，尤其是治疗GVHD。动物实验证明间充质干细胞能有效地治疗消除炎症[。有研究评价了137例类风湿性关节炎患者，患者在间充质干细胞治疗后并不出现免疫毒性。因此， 间充质干细胞治疗引起的发烧与免疫反应、炎症反应无关。
大样本临床研究证明间充质干细胞治疗的安全性
亦有学者对目前大量的临床试验的文献进行分析（Meta-Analysis），发现 间充质干细胞输入治疗仅仅与发烧存在一定的关联性，而与其他文献所报道的不良反应没有必要的联系，认为间充质干细胞治疗是安全的。其实人体中就广泛存在MSC，从来没发现人体内的MSC会癌变，或者肿瘤来源于MSC。 间充质干细胞细胞本身是安全的，间充质干细胞治疗的不良反应与间充质干细胞悬液中的一些杂质有密切的联系，比如内毒素含量、胎牛血清的残留量等。总体来看，间充质干细胞治疗具有良好的安全性记录，对病人无明显毒副作用，少数病人出现注射局部不适、短暂低热等，对症处理即可。
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