间充质干细胞与T细胞
研究发现，在避免间充质和Ｔ细胞接触的实验中，Ｔ细胞增殖也能被一定程度地抑制，说明间充质能够通过分泌相关因子发挥其免疫调节作用。细胞间的直接接触是间充质干细胞发挥其强大抑制作用的必要条件。研究人员设计了一种实验方法促使间充质无法和Ｔ细胞接触，此时间充质干细胞对Ｔ细胞的抑制作用较弱，但是在允许间充质干细胞和Ｔ细胞接触的条件下，其对Ｔ细胞的抑制作用会变得较强。
间充质干细胞与B细胞
间充质干细胞可以抑制B细胞的增殖、抗体的分泌以及影响B细胞的趋向性。间充质干细胞与Ｂ细胞的作用机制是通过细胞之间的直接接触来发挥作用。同时也可通过分泌可溶性细胞因子对Ｂ细胞起调节作用。研究表明，间充质干细胞抑制Ｂ细胞的增殖和抗体的产生是Ｔ细胞介导的。
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